Dans les années 1980, Chloé Sainte-Marie est révélée par le cinéaste Gilles Carle. Elle obtient le rôle principal dans La guêpe en 1986, le prix d’interprétation féminine au Festival du film d’aventure de Pau, en France. En 1990, la pièce de théâtre La terre est une pizza de Gilles Carle est présentée au festival d’Avignon et deux mois durant à Paris. Elle joue ensuite La postière en 1991 et Pudding chômeur en 1996.
En 1985, elle interprète avec François Guy la chanson thème que ce dernier a écrit pour le film Cinéma, cinéma. La même année elle interprète un rôle dans le film Ô Picasso. Un peu plus tard, elle est de la distribution du film Vive Québec, un documentaire-fiction.
Son premier album, L’emploi de mon temps sorti en 1993 et signé Fernando Arrabal a été un banc d’essai. Au milieu de la décennie suivante, elle enregistre une trilogie d’albums sur lequel elle chante les poètes québécois. Je pleure, tu pleures sort en 1999 récolte six nominations au gala de l’Association québécoise de l'industrie du disque, du spectacle et de la vidéo (Adisq). En octobre 2002, l’album Je marche à toi remporte le Félix dans la catégorie Album de l’année – Folk contemporain au gala de l’Adisq 2003. L’année suivante, une tournée conduit Chloé Sainte-Marie en France, en Suisse et en Belgique où elle récolte plusieurs prix, dont le prix Charles Cros. En 2005, elle propose un album intitulé Parle-moi consacré à la poésie de Gaston Miron.
Suit, en 2009, un album en langue innue, Nitshisseniten e tshissenitamin (Je sais que tu sais), en hommage à Philippe McKenzie fondateur du mouvement folk innu, le premier à chanter dans sa langue maternelle. À l’aide de la poète Joséphine Bacon, Chloé Sainte-Marie se consacre à l’apprentissage du parler innu, de la langue des premières nations et fait de ce projet un spectacle mis en scène par Brigitte Haentjens.
En novembre 2011, elle présente l’album Une étoile m’a dit, un conte musical de Gilles Carle et Michèle Cournoyer mis en musique par François Guy, entouré d’Yves Desrosiers, Émile Proulx-Cloutier, Bernard Adamus, Florent Vollant, Yves Lambert, Éloi et Jonathan Painchaud, Henry-Paul Besnard, Le Vent du Nord et la Bande Magnétique.
L’année 2014 marque la parution de l’album, *À la croisée des silences *sur lequel Chloé Sainte-Marie s’est entourée d’une vingtaine de poètes québécois, dont les mots ont été mis en musique par Sylvie Paquette et Yves Desrosiers, et la réalisation et les arrangements signés par Réjean Bouchard.
